Oprogramowanie

Obrazowanie medyczne

http://www.idoimaging.com/index.shtml – prezentowane tutaj oprogramowanie może znaleźć zastosowanie w wizualizacji i analizie danych uzyskanych dzięki różnorodnym technikom obrazowania medycznego. Jest tu zebrane zarówno oprogramowanie komercyjne jak i wolnodostępne na wszystkie platformy systemowe.

W zasobach internetu można znaleźć zestawy zdjęć uzyskanych tego typu technikami. Jednym z większych jest zbiór prowadzony przez Genewski Szpital Uniwersytecki. Mimo, że ostatnia aktualizacja tego zbioru miała miejsce w 2007 roku, to materiały znajdujące się na tej stronie nie straciły na atrakcyjności.

Analiza numeryczna

W dobie szybkiego rozwoju technik informatycznych zarówno w warstwie sprzętu jak i oprogramowania analiza numeryczna stała się jednym z podstawowych narządzi jakimi może posługiwać się inżynier, w tym inżynier biomedyczny. Do języka inżynierii wchodzi pojęcie eksperymentu numerycznego. Jeszcze nie tak dawno pojęcie eksperymentu zarezerwowane było dla obiektów materialnych. Dziś przenika do sfery wirtualnej. Wśród wielu programów służących szeroko pojętej analizie numerycznej do najważniejszych zaliczyć należy:

ANSYS – program służący do modelowania numerycznego i prowadzenia analiz w bardzo szerokim zakresie, posługujący się Metodą Elementów Skończonych – MES (ang. Finite Element Method – FEM). Z czego dumny może być każdy polski inżynier (nie tylko biomedyczny), to fakt, iż podwaliny tej metody oraz następnie jej rozwój zawdzięczamy w dużej mierze Olgierdowi Zienkiewiczowi.

ABAQUS – podobnie jak Ansys, program ten wykorzystuje Metodę Elementów Skończonych.

Obliczenia statystyczne, obróbka i prezentacja danych

Do obróbki danych liczbowych pochodzących z eksperymentu (także numerycznego) dostępnych jest wiele programów, wręcz całych pakietów. Jednak nawet najlepiej przeprowadzona obróbka danych nie obroni się bez profesjonalnej jej prezentacji Poniżej wymieniono kilka programów pomocnych w uzyskaniu zadowalającego efektu.

Scilab – darmowy pakiet naukowy, stworzony do badań matematycznych – od prostych obliczeń, przez macierze, algebrę liniową, przetwarzanie sygnałów, statystykę przez wiele innych dziedzin (za Wikipedią). Program ten dostępny jest na wszystkie platformy systemowe. Stanowi, obok GNU Octave oraz R, darmową alternatywę dla MATLABA.

TeX – komputerowy system profesjonalnego składu drukarskiego. Szczególnie często używa się go przy składaniu tekstów naukowych (np. matematycznych), ponieważ umożliwia budowanie dość złożonych wyrażeń, w tym skomplikowanych wzorów matematycznych. Nie mniej ważny jest szeroki zakres dostępnych gotowych pakietów poleceń rozwiązujących mniej lub bardziej typowe problemy związane z tworzeniem publikacji, są to np. automatyczne numerowanie równań, tworzenie skorowidzów, tabel, spisu skrótów, wstawianie prostych ilustracji (za Wikipedią). System ten jest bardzo popularny w środowiskach naukowych. Cześć uczelni dąży do tego, aby wykorzystywać TeX-a podczas pisania prac i tekstów naukowych, wypracowując przy tym własne schematy. Niektóre czasopisma naukowe wykorzystują ten system i wymagają od autorów składu tekstu z jego udziałem. Mimo początkowego trudu jaki należy włożyć w opanowanie tego systemu, efekt końcowy znacznie przewyższa możliwości typowych pakietów biurowych z rodzaju WYSIWYG (Microsoft Office, OpenOffice, itp.).

Pakiety biurowe WYSIWYG względem systemu TeX bronią się przede wszystkim łatwością obsługi oraz szerszą dostępnością. Pakiet firmy Microsoft jest obecnie dostępny na wielu uczelniach w postaci darmowej dla studentów oraz pracowników naukowych. Pakiet OpenOffice jest jego funkcjonalnym, darmowym odpowiednikiem dostępnym w Internecie. Istnieje wiele innych pakietów biurowych, bardziej lub mniej złożonych, na wszystkie (w tym przenośne) platformy systemowe.